Mauro Cassinari si è diplomato in saxofono al Conservatorio di "Luca Marenzio" di Brescia. Ha conseguito il diploma accademico di secondo livello a indirizzo interpretativo, per la disciplina di saxofono, presso il Conservatorio "Franco Vittadini" di Pavia con il massimo dei voti. Ha seguito master in Italia e all’estero con J.M.Londeix e F. Mondelci.
Ha vinto concorsi nazionali in formazioni duo (saxofono e pianoforte) e in quartetto di saxofoni. Ha collaborato con varie orchestre sinfoniche come la Civica Orchestra di Fiati del Comune di Milano, l’Orchestra del Teatro Rosetum di Milano, l’Orchestra "G. Verdi" di Milano (direttore Riccardo Chailly).
In ambito jazzistico, ha collaborato con l’Orchestra della Civica Scuola di Pavia (direttore Emilio Soana), con varie formazioni jazz (Safe sax, Paciugo) e con l’orchestra swing di Alfredo Rey con cui ha tenuto concerti in Italia e partecipato a importanti trasmissioni radiofoniche (primo canale della Svizzera Italiana) e televisive (“Markette” di Piero Chiambretti e “Lo spaccanoci” di Fabio Volo).
Nel 1992 ha preso parte al Congresso Mondiale del Saxofono di Pesaro con l’ottetto di Sandro Cerino, nel 1996 all'edizione “Suoni del Tempo” a Cesena e nel 1998 alla stagione di concerti “Tempo Reale” diretta da Luciano Berio a Firenze, eseguendo un brano per saxofono e live elettronics composto da Fabio Nieder e Jacopo Baboni Schilingi. Ha inoltre ha partecipato a esecuzioni di opere del compositore Salvatore Sciarrino. Nel 2000 è al festival jazz di Clusone con il quartetto di saxofoni Safe sax.
Ha inciso cd di musica jazz, contemporanea e classica.
Dal 1985 al 1989 è docente di saxofono presso le scuole civiche di Corsico e Cesano Boscone; dal 1990 al 2008 nei corsi CEP (poi CEM) del Comune di Milano.
Dal 2008 insegna presso Milano Civica Scuola di Musica.